汽车消毒有多种方法，从大类上可以分为化学消毒、臭氧消毒、活性炭消毒等方式，小类上可分为酒精溶液及杀菌喷剂等，具体的选择因人而异。
化学消毒
化学消毒普遍采用酒精溶液或杀菌喷剂，通过对车舱内部物件进行涂抹或喷洒来达到消毒作用，优点是杀菌针对性强效果好，缺点是会使化学成分残留，如果长期无法挥发会对人体造成不同程度的影响。
臭氧消毒
臭氧消毒通过强氧化性，对空气进行过滤来达到消毒抑菌的效果，有效分解葡萄糖氧化酶致使细菌死亡，其优点在于简单便捷，对清除车内异味也有较好的效果，缺点在于臭氧会对人体呼吸道等造成损害。
活性炭消毒
活性炭通过颗粒空隙带来极强吸附力，在去甲醛等领域有很好的表现，优点在于是物理消毒，对人体不产生直接伤害，缺点在于生物降解作用较低，循环利用的可能性小。